Instituída em 12 de novembro de 2008 através da doação de bens livres de professores da Universidade Federal da Grande Dourados – UFGD, visando a melhoria no desenvolvimento de seus projetos de ensino, pesquisa e extensão, a Fundação de Apoio ao Ensino, Pesquisa e Extensão – FUNAEPE é uma instituição de direito privado, sem fins lucrativos, sem acionistas ou cotistas, dotado de autonomia administrativa, patrimonial e financeira, devidamente credenciada junto aos Ministérios da Educação (MEC) e de Ciência e Tecnologia (MCT). Como Fundação de Apoio, tem por finalidade principal, apoiar a Universidade Federal da Grande Dourados – UFGD no desenvolvimento de ações de ensino, pesquisa e extensão. Na consecução de seus objetivos, pode apoiar projetos de ensino pesquisa, extensão, desenvolvimento institucional, cientifico e tecnológico nas diversas áreas do conhecimento e ainda organizar e prestar serviços a órgãos ou entidades, podendo celebrar convênios, contratos, acordos e outros instrumentos, com entidades públicas ou privadas.

Buscando alcançar seus objetivos estatutários, a FUNAEPE vem se estruturando para o melhor gerenciamento e gestão de projetos da UFGD, financiados com recursos captados através de parcerias com órgãos de fomento do Governo Federal, através de seus Ministérios e Secretarias, tendo como meta também, a captação de recursos próprios para apoiar ações de ensino, pesquisa e extensão da UFGD.